ここは、赤色銀河「ネフィーリア」。
多くの星々は「ブレイン」と呼ばれる種族とブレインによって作られた
機械種族「プラチナ」によって支配されていた。

ある宙域で偵察と調査任務にあたっていたプラチナの「レイナ」は、
記憶を失った素性不明の同胞
「アルト」を救助する。
しかし、宇宙船を予期せぬトラブルが襲い、
二人は未知の宙域へと転移させられてしまう。

辿り着いたのは、
未知の惑星「アーク」。
アークに不時着した
レイナたちであったが、
同胞であるはずのプラチナ軍によって投獄されてしまう。

牢獄の中で彼女はアークの住人
「ピギー」から、
この惑星に隠された
驚愕の事実を告げられる。
アークは、ブレインとプラチナ軍が、
生体実験を行うための惑星だったのだ。
惑星アークの実態に憤りを覚えたレイナはブレインたちに反旗を翻す解放団
「フロンティア・アーク」や
アルトと共に、惑星アークからの
脱出を決意する。